醫(yī)院注重學科建設,遵循以“外科為龍頭，內科為基礎，康復為特色”的學科建設格局，逐步建立以重點學科為基礎，集項目、人才、平臺、環(huán)境為一體的醫(yī)學科技創(chuàng)新體系。神經內科、腫瘤科(培育項目)為浙北區(qū)域專病中心，康復醫(yī)學科、麻醉(疼痛)學科為浙江省醫(yī)學重點扶植學科，康復醫(yī)學、臨床藥學為浙江省中醫(yī)藥重點學(專)科，骨外科學、兒科學、心血管病學、運動醫(yī)學為省市共建醫(yī)學扶植重點學科，兒科學、放射醫(yī)學、骨外科學、康復醫(yī)學、麻醉學、普通外科學、神經病學、神經外科學、腫瘤學、臨床藥學、泌尿外科學、耳鼻咽喉科學、護理學、臨床微生物診斷學為嘉興市醫(yī)學重點學科，中西醫(yī)結合護理學、中西醫(yī)結合康復醫(yī)學為嘉興市中醫(yī)藥重點學科。