本院是上海市區(qū)域性醫(yī)療中心，世博醫(yī)療聯(lián)合體牽頭單位。二十世紀(jì)七十年代，為改進(jìn)黃浦江東岸區(qū)域居民就醫(yī)難的問題，原上海市南市區(qū)政府及上海市衛(wèi)生局在浦東南碼頭路與浦東南路交界處建立起一所區(qū)級綜合醫(yī)院，命名為浦南醫(yī)院。1993年，浦南醫(yī)院正式更名為“上海市浦東新區(qū)浦南醫(yī)院”;2003年，浦東新區(qū)社發(fā)局與上海藍(lán)十字醫(yī)院辦理投資有限公司簽訂合作協(xié)議，醫(yī)院開始踏上了“國有民營、托付辦理”的改革探索之路;2009年，醫(yī)院結(jié)束“國有民營 托付辦理”形式;2013年晉升為二級甲等綜合醫(yī)院。