福建醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院始建于1881年，原名“惠世醫(yī)院”，為英國教會醫(yī)院。1973年整建制劃歸福建醫(yī)科大學(xué)，更名為福建醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院。醫(yī)院是福建省首批通過衛(wèi)生部評審的四家三級甲等綜合醫(yī)院之一，是我省主要的醫(yī)療、教學(xué)、科研、畢業(yè)后教育基地之一，是博士、碩士研究生學(xué)位授權(quán)點單位、博士后科研工作站。是省級區(qū)域醫(yī)療中心，福建省呼吸醫(yī)學(xué)中心掛靠單位。醫(yī)院在全國三級公立醫(yī)院績效考核評價中連續(xù)兩年進入全國前10%，等級A+。醫(yī)院榮獲第六屆“全國文明單位”榮譽稱號。