醫(yī)院始創(chuàng)于1948年，前身為中國紅十字會青浦分會醫(yī)院，2002年1月冠名為復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院青浦分院、上海市青浦區(qū)中心醫(yī)院。1995年被世界衛(wèi)生組織(WHO)認(rèn)定為愛嬰醫(yī)院，1998年起連續(xù)七屆被評為上海市文明單位，2003年被指定為青浦區(qū)臺胞臺商定點醫(yī)院。2008年，在新一輪上海市區(qū)域衛(wèi)生規(guī)劃項目中被納入郊區(qū)三級醫(yī)院建設(shè)單位之一，2012年底圓滿完成了三級醫(yī)院等級評審工作。