醫(yī)院設有59個臨床醫(yī)技科室;擁有2個國家重點?？?、1個省級臨床醫(yī)學研究中心、15個省級臨床重點?？?全市22個)、2個廈門大學首批學系、4個市級醫(yī)學中心、2個市級研究所、6個市領先學科、7個市級重點學科，10個市規(guī)劃重點學科，7個市級專病防治中心，17個市級質控中心。